Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及特异性终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合链和脱氧核糖核酸 DNA 组合而成的特殊核酸构造，在原核和真核生物的DNA组当中分布为广泛且特别是在。R-loop 在很多关键的遗传学过程当中发挥关键机制，有数染色质粘贴、磷酸化磷酸化、DNA 损害修复以及DNA组稳定性等，但其如何被精确磷酸化的选择性已为不清楚。m6A 粘贴作为信使 RNA 上总质量最高的粘贴类型，为广泛参与哺乳动物的发育、自体、生殖细胞更新、脂肪酸分化、以及病变生成和转移等灵魂过程。然而，目前已为不清楚 m6A 有否能作为 R -loop 当中 RNA 成分的本源特征来磷酸化 R -loop 低水平，进而发挥各种遗传学机制。钱学森北京DNA组科学研究所杨运桂、任捷与浙江大学生科院孙前文的团队合作科学研究，辨认出 m6A 能稳定 R-loop 的逐步形成，进而磷酸化DNA磷酸化的有效终止。这一成果以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 同月 12 日离线发表于《细胞科学研究》（Cell Research）杂志。科学研究的团队首先通过斑块分子杂交和自体荧光应用，辨认出敲低 m6A 中三基转移酶 METTL3 祚着减低 R -loop 低水平，且该磷酸化抑制作用依赖于 METTL3 中三基转移酶活性。随后，的团队核心人物透过高效液相色谱联合行动小分子应用，辨认出相较于染色体结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 成分有更加富含的 m6A 粘贴。更进一步透过基于脱氧核糖核酸 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合链自体共有沉淀高通量测序应用（ssDRIP-seq），辨认出下调的 R -loop 主要富含在磷酸化终止区外，R-loop 变化程度与 m6A 的距离和粘贴低水平无关。为了探索 m6A 对 R -loop 磷酸化的遗传学机制，科学研究的团队绘成了 RNA 催化反应磷酸化位点的高分辨率著者，并在 MYC、ACTIN DNA上进行多种磷酸化活性测定，辨认出 m6A 促进 R -loop 逐步形成是磷酸化终止阶段性的关键步骤，可以不必要 RNA 催化反应的磷酸化通读。再一，的团队核心人物构建了针对磷酸化通读的报告DNA系统，通过 m6A 粘贴位点的等位DNA更进一步声称 m6A 对于 R -loop 逐步形成及磷酸化终止的关键抑制作用。该科学研究辨认出了 m6A 酪氨酸粘贴的共有磷酸化磷酸化机制，揭示了 RNA 酪氨酸粘贴对染色质构造的影响，以及 R-loop 构造当中的 RNA 成分被粘贴后对其自身二阶的磷酸化选择性，阐释了 m6A 通过稳定 R-loop 而促进磷酸化正常终止的震荡，为更进一步科学研究 m6A 与 R-loop 的磷酸化选择性和除此以外遗传学机制提供了必需的应用和分析方法当中空。该科学研究给与了当中国科学院一环先于新技术专项、国际组织自然科学以及国际组织重点研制计划等基金支助。类似出处：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).