Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地绘制出人类肠道的扰生态系统目录!

2022-02-07 05:01:05 来源:
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已对,一项刊文在国际间月刊Nature Biotechnology上文中会“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的数据分析报告中会,来自欧洲分子生物学麻省理工学院等机构的科学家们通过数据分析将生命大肠病原体第三组中会所有已确定的大肠杆菌基因第三组评注形同了一个大型的数据集库,从而就能借助数据分析人员深入即使大肠杆菌基因和蛋白之间的关联,以及其对生命健康的制约。

大肠杆菌内有肾脏外,其并能产生蛋白来制约飞翼消化、健康和对疾病的易感性,其如此普遍以至于人体病原体第三组形同员的数量要比人体细胞还要多,最主要大肠杆菌、寄生虫和其它病原体;为了思考大肠杆菌在生命生物学中会所饰演的关键反派,科学家们通常会在麻省理工学院中会分离并对其培养,随后在对大肠杆菌顺利进行DNA分子生物学,然而现阶段很多大肠杆菌还无法在麻省理工学院的环境污染中会被培养生殖。

为了取得这些大肠杆菌的关的文档,数据分析人员回避了另外一种步骤,他们从环境污染中会(比如大肠)抽取一般而言结果显示,随后在对整个结果显示中会的DNA顺利进行分子生物学,然后利用计算机步骤对来自一般而言结果显示中会的数千种特有种的群体基因第三组顺利进行改建,这种步骤被指俊分子生物学技术,该技术能作为一种替代步骤对单个特有种的DNA顺利进行分离和分子生物学。

数据分析者Rob Finn回应,去年最主要我们在内的三个法理开发团队改建了形同千上万个大肠病原体第三组基因第三组,而仅次于的问题就是这些开发团队所得不到的结果是不是具有可比性,以及是不是能将这些结果评注形同为一个并不全面的清单。现阶段数据分析人员已经从生命大肠中会超过4600种大肠杆菌生境中会评注了20万个基因第三组和1.7亿个蛋白脱氧核糖核酸,这种新型的数据集库(为统一的生命胃大肠基因第三组集合和为统一的胃大肠蛋白书目)揭示了飞翼大肠的巨大社会性,并为进一步顺利进行大肠病原体第三组数据分析过渡到了道路。

数据分析者绘制单单的这个巨大的书目是病原体第三组数据分析的一个里程碑,未来或将能为科学家们提供并不可贵的海洋资源来数据分析生命大肠生存环境污染中会每一种大肠杆菌所饰演的关键反派。这项数据分析表明,超过70%被探测到的大肠杆菌从而在麻省理工学院中会被形同功培养过,而其在毒素的活性依然可能,而这类大肠杆菌中会仅次于的小团体就是Comantemales;数据分析者回应,看得见Comantemales如此广泛说道一个欢笑,这就凸显了我们的确对大肠中会的大肠杆菌知之甚少,我希望这个书目能借助生物文档学家和分子生物学家在未来几年补救这一知识空白。

该数据集库/书目抽取的所有数据集都能在在线海洋资源Mgnify中会取得,其能借助科学家们分析病原体的基因第三组数据集并且与意味著的数据集库顺利进行对比;随着欧美数据分析开发团队大幅度发表新的数据集库,该书目会缩小到最主要其它飞翼部位的病原体第三组,比如黏膜或口腔结构上等部位。最后数据分析者回应,这一书目的评注未来或为病原体学家和临床数据分析人员提供并不丰富的海洋资源,然而数据分析人员会在南美洲、亚太地区和非洲等特色不足的内陆地区发现更多新的大肠杆菌特有种,现阶段数据分析人员并不清楚相异人群中会大肠杆菌社会性的差异和变化情况。

早期单单处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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